Datasetpublic

okbro1234/TCGA_Brain

TCGA_Brain 1. Tổng quan [CẦN ĐIỀN THỦ CÔNG: mục đích, ngữ cảnh tạo dataset] Tổng số bản ghi: 1704 Repo HuggingFace: okbro1234/TCGA_Brain 2. Cấu trúc lưu trữ tại đích / (Suy tự động từ hàm HfApi trong notebook gốc; PATH_PREFIX hiện tại = ``) 3. Manifest và các cột dữ liệu Cột Dtype Số giá trị thiếu (NaN) file_id object 0 file_name object 0 slide_id object 0 data_format object 0 experimental_strategy object 0… See the full description on the dataset page: https://huggingface.co/datasets/okbro1234/TCGA_Brain.

sourceHugging Faceupdated 23d agoView on Hugging Face

0likes89downloads

Dataset Card

TCGA_Brain

1. Tổng quan

[CẦN ĐIỀN THỦ CÔNG: mục đích, ngữ cảnh tạo dataset]

—Tổng số bản ghi: 1704
—Repo HuggingFace: okbro1234/TCGA_Brain

2. Cấu trúc lưu trữ tại đích

(Suy tự động từ hàm HfApi trong notebook gốc; PATH_PREFIX hiện tại = ``)

3. Manifest và các cột dữ liệu

Cột	Dtype	Số giá trị thiếu (NaN)
file_id	object	0
file_name	object	0
slide_id	object	0
data_format	object	0
experimental_strategy	object	0
access	object	0
file_size	int64	0
case_id	object	0
project_id	object	0
primary_diagnosis	object	0
label_raw	object	0
label_4class	object	91
label_3class	object	293
labellgggbm	object	0

4. Nhãn phân loại (Labels)

Nguồn dữ liệu phát hiện được:

—TCGA-GBM
—TCGA-LGG

primary_diagnosis

class	count	pct
Glioblastoma	829	48.65
Mixed glioma	202	11.85
Oligodendroglioma, NOS	198	11.62
Oligodendroglioma, anaplastic	147	8.63
Astrocytoma, anaplastic	142	8.33
Astrocytoma, NOS	95	5.58
Not Reported	55	3.23
Unknown	22	1.29
Adenocarcinoma, NOS	8	0.47
Basal cell carcinoma, NOS	5	0.29
Papillary carcinoma, NOS	1	0.06

[image]

Breakdown theo nguồn (project_id):

primary_diagnosis	TCGA-GBM	TCGA-LGG
Adenocarcinoma, NOS	8	0
Astrocytoma, NOS	0	95
Astrocytoma, anaplastic	0	142
Basal cell carcinoma, NOS	0	5
Glioblastoma	829	0
Mixed glioma	0	202
Not Reported	1	54
Oligodendroglioma, NOS	0	198
Oligodendroglioma, anaplastic	0	147
Papillary carcinoma, NOS	0	1
Unknown	22	0

[image]

label_raw

class	count	pct
Glioblastoma	829	48.65
Mixed glioma	202	11.85
Oligodendroglioma, NOS	198	11.62
Oligodendroglioma, anaplastic	147	8.63
Astrocytoma, anaplastic	142	8.33
Astrocytoma, NOS	95	5.58
Not Reported	55	3.23
Unknown	22	1.29
Adenocarcinoma, NOS	8	0.47
Basal cell carcinoma, NOS	5	0.29
Papillary carcinoma, NOS	1	0.06

[image]

Breakdown theo nguồn (project_id):

label_raw	TCGA-GBM	TCGA-LGG
Adenocarcinoma, NOS	8	0
Astrocytoma, NOS	0	95
Astrocytoma, anaplastic	0	142
Basal cell carcinoma, NOS	0	5
Glioblastoma	829	0
Mixed glioma	0	202
Not Reported	1	54
Oligodendroglioma, NOS	0	198
Oligodendroglioma, anaplastic	0	147
Papillary carcinoma, NOS	0	1
Unknown	22	0

[image]

label_4class

class	count	pct
Glioblastoma	829	51.39
Oligodendroglioma	345	21.39
Astrocytoma	237	14.69
Oligoastrocytoma	202	12.52

[image]

Breakdown theo nguồn (project_id):

label_4class	TCGA-GBM	TCGA-LGG
Astrocytoma	0	237
Glioblastoma	829	0
Oligoastrocytoma	0	202
Oligodendroglioma	0	345

[image]

label_3class

class	count	pct
Glioblastoma	829	58.75
Oligodendroglioma	345	24.45
Astrocytoma	237	16.8

[image]

Breakdown theo nguồn (project_id):

label_3class	TCGA-GBM	TCGA-LGG
Astrocytoma	0	237
Glioblastoma	829	0
Oligodendroglioma	0	345

[image]

labellgggbm

class	count	pct
GBM	860	50.47
LGG	844	49.53

[image]

Breakdown theo nguồn (project_id):

label_lgg_gbm	TCGA-GBM	TCGA-LGG
GBM	860	0
LGG	0	844

[image]

5. Cách tải và sử dụng

[CẦN ĐIỀN THỦ CÔNG: hướng dẫn tải/sử dụng dataset, ví dụ code snippet]

6. Quy trình tái tạo (Reproducibility)

[CẦN ĐIỀN THỦ CÔNG: mô tả các bước chạy lại pipeline tải + upload]

7. Giới hạn và lưu ý

—label_4class: class 'Glioblastoma' chiếm 51.39% tổng số
—label_3class: class 'Glioblastoma' chiếm 58.75% tổng số
—labellgggbm: class 'GBM' chiếm 50.47% tổng số

8. Trích dẫn / Nguồn tham khảo

[CẦN ĐIỀN THỦ CÔNG: paper/license/citation liên quan]