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Atsushi/fungi_diagnostic_chars_comparison_japanese

fungi_diagnostic_chars_comparison_japanese大菌輪「識別形質まとめ」データセット最終更新日 / Last updated: 2026/8/29(up to R3-14214) Languages Japanese This dataset is available in Japanese only. 概要 / Overview Atsushi Nakajima(中島淳志)が個人で運営しているWebサイト大菌輪では、数千件以上の菌類分類学論文を「論文3行まとめ」という形で要約および索引付け(インデキシング)した情報を提供しています。その一環として、ある菌と別の菌の「共通する」あるいは「異なる」識別形質 (diagnostic characters) に関する記述を人手で抽出しています。 Daikinrin, a personal website run by Atsushi Nakajima, provides summaries and… See the full description on the dataset page: https://huggingface.co/datasets/Atsushi/fungi_diagnostic_chars_comparison_japanese.

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fungidiagnosticcharscomparisonjapanese 大菌輪「識別形質まとめ」データセット 最終更新日 / Last updated: 2026/8/29(up to R3-14214) ====

Languages

Japanese

This dataset is available in Japanese only.

概要 / Overview

Atsushi Nakajima(中島淳志)が個人で運営しているWebサイト大菌輪では、数千件以上の菌類分類学論文を「論文3行まとめ」という形で要約および索引付け(インデキシング)した情報を提供しています。その一環として、ある菌と別の菌の「共通する」あるいは「異なる」識別形質 (diagnostic characters) に関する記述を人手で抽出しています。

Daikinrin, a personal website run by Atsushi Nakajima, provides summaries and indexes for thousands of mycological taxonomic papers in the form of "Three-line Paper Summaries." As part of this process, descriptions of "common" or "different" diagnostic characters between fungi are manually extracted.

本データセットは、抽出された識別形質の一覧に、「色/color」、「形状/shape」などのカテゴリを半自動的に付与して集積したものです。

This dataset is a compilation of the extracted diagnostic characters, semi-automatically categorized with labels such as "color" and "shape."

「論文3行まとめ」は毎日更新していますが、本データセットの更新はおおむね1ヶ月に一度とする予定です。

While the "Three-line Paper Summaries" are updated daily, this dataset is updated approximately once a month.

関連データセット / Related Datasets

  1. 1.「論文3行まとめ」 / "Three-line Paper Summary" Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese
  1. 1.「Trait Circusデータセット」(統制形質) / "Trait Circus Dataset" (Controlled Traits) Atsushi/fungi_trait_circus_database

各カラムの説明 / Column Descriptions

カラム名<br>Column Name説明<br>Description
R3ID大菌輪「論文3行まとめ」のID<br>ID for Daikinrin "Three-line Paper Summary"
No各識別文を一意のIDで区別するために、各R3IDにおいてナンバリングしたもの<br>Numbering within each R3ID to uniquely identify each diagnostic sentence
comparison_source比較元の分類群(学名)<br>Source taxon (scientific name) for comparison
comparison_target比較先の分類群(学名)<br>Target taxon (scientific name) for comparison
sentence識別文(全て日本語)<br>Diagnostic sentence (all in Japanese)
label半自動的に付与されたカテゴリ(人手で修正していますが、ダブルチェックは行っていないので誤分類もあると思います)<br>Semi-automatically assigned category (manually corrected, but not double-checked, so there may be misclassifications)
commonordifferent共通する形質は「1」、異なる形質は「0」<br>"1" for common traits, "0" for different traits
data_source各情報の出典(文献)のURL<br>URL of the source (literature) for each piece of information

ラベルのカテゴリ / Label Categories

  • —サイズ/size
  • —分子系統解析/molecularphylogeneticanalysis
  • —形状/shape
  • —色/color
  • —地理的分布/geographical_distribution
  • —生息環境/habitat
  • —表面性状/surface_characteristics
  • —構造/structure
  • —有無/presence
  • —形態全般/general_morphology
  • —位置/position
  • —二次代謝産物/secondary_metabolite
  • —呈色反応/chemical_reaction
  • —数量/amount
  • —発達/development
  • —生理学的形質/physiological_characters
  • —分類/classification
  • —資化・発酵能/assimilationandfermentation
  • —質感/texture
  • —味・臭い/tasteandsmell
  • —病害・病原性関連/diseaseandpathogenecity
  • —全般/general_characters
  • —耐性・感受性/resistanceandsusceptibility
  • —栄養摂取様式/nutrition_style
  • —未分類/unclassified