jiduer233/biomni_v2.0

Biomni - Biomedical AI Agent

通用生物医学 AI Agent，支持单细胞分析、RNA-seq、生存分析等。

功能

• —🧬 单细胞转录组分析 (Scanpy/Seurat)
• —📊 差异表达分析 (DESeq2)
• —🏥 生存分析 (Cox/KM)
• —🤖 多 Agent 协作
• —🔍 文献检索和知识整合

技术栈

• —Python 3.10
• —FastAPI + Uvicorn
• —Scanpy / Seurat
• —LangChain + LLM
• —Gradio (Web UI)

使用方法

1. 1.打开应用链接
2. 2.在输入框输入分析需求
3. 3.点击提交
4. 4.等待分析结果

本地部署

git clone <repo>
cd biomni-web-fork
conda env create -f biomni_env/environment.yml
conda activate biomni_e1
biomni web

文档

• —GitHub
• —文档

许可证

Apache License 2.0